Winx Club 2. Sezon'da, Bloom, Stella, Flora, Tecna ve Miusa ikinci yıla geçiş sınavlarını başarıyla verirler. Kızlar grubuna, yeni bir üye de katılır: Andros prensesi Layla. Ayrıca Winx Club üyelerinin bundan sonra Pixie adlı bir miniperisi olacaktır. Trix'in kötü güçleriyle mücadele eden kızların yanında yine Kızıl Çeşme uzmanlarını göreceğiz. Bu arada Trix de kendi grubunu güçlendirmek ve Ejder Ateşi gücünü ele geçirmek üzere saflarına yeni bir üye katmıştır.

Gölgedeki Casus

Professor Avalon, Bloom'u kendi gücü hakkında daha fazla şey öğrenmesi için sihirli bir yolculuğa gönderir. Orada karakterini kötü yönde değiştiren gizemli bir Gölge Virüsü kapar. Winx ve Pixies, bu virüsün etkisiyle Lord Darkar için Alfea Codex'ini çalmadan önce Bloom'u durdurmalıdır.

Pixie Kasabası

Winx kızları, Uzmanlar ve Pixieler biraz dinlenmek ve kayak yapmak için Wildland'e seyahat ederler. Tehlikeli bir durum ortaya çıktığında Bloom ve diğerleri sihirlerinin Wildland'de kullanılamadığını fark ederler. Bu sırada, Profesör Avalon zehirli bir bitki yüzünden hastalanır ve küçük Pixie Livi onu kurtarmak için zamanla yarışmak zorundadır!